Kế hoạch của Bộ Giáo dục và Đào tạo trước đó quy định tất cả các cụm thi đều phải hoàn thành công tác chấm thi và gửi dữ liệu lên Hệ thống quản lý kỳ thi THPT quốc gia của Bộ chậm nhất là ngày 20/7. Theo đó, tùy tình hình mà các cụm có kế hoạch chấm riêng nhưng phải bố trí sao để không ảnh hưởng đến lịch chung. Sau khi so sánh, đối chiếu với kết quả đã được nhập lên hệ thống, các cụm có thể bắt đầu công bố điểm thi THPT quốc gia 2016. Như vậy, năm nay các cụm đều có quyền công bố điểm thi và việc công bố tùy thuộc vào kế hoạch của cụm. Cụm nào hoàn thành trước có thể công bố trước nên thời điểm công bố có thể không đồng nhất. Chậm nhất là đến ngày 30/7, điểm thi sẽ phải được công bố để thí sinh bắt đầu nộp đơn xét tuyển đại học, cao đẳng. 

Trong kỳ thi năm nay, có 70 cụm thi đại học do các trường đại học chủ trì và 50 cụm thi tốt nghiệp do các Sở Giáo dục và Đào tạo địa phương phụ trách được phép công bố điểm thi. Cụ thể như sau:

 Danh sách 70 cụm thi đại học công bố điểm thi THPT quốc gia 2016: 

Cụm thi số 1: Đại học Bách khoa Hà Nội Cụm thi số 2: Đại học Sư phạm Hà Nội Cụm thi số 3: Đại học Thủy lợi Cụm thi số 4: Học viện Kĩ thuật Quân sự Cụm thi số 5: Đại học Lâm nghiệp Cụm thi số 6: Đại học Bách khoa – Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 7: Trường Đại học Khoa học tự nhiên – Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 8: Đại học Khoa học xã hội và Nhân văn – Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 9: Đại học Sư phạm Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 10: Đại học Hàng hải Việt Nam Cụm thi số 11: Đại học Sư phạm – Đại học Thái Nguyên Cụm thi số 12: Đại học Kỹ thuật công nghiệp – Đại học Thái Nguyên Cụm thi số 13: Đại học Nông lâm – Đại học Thái Nguyên Cụm thi số 14: Học viện Ngân hàng Cụm thi số 15: Đại học Luật Hà Nội Cụm thi số 16: Đại học Tân Trào Cụm thi số 17: Đại học Xây dựng Cụm thi số 18: Đại học Khoa học – Đại học Thái Nguyên Cụm thi số 19: Đại học Thái Nguyên Cụm thi số 20: Học viện Tài chính Cụm thi số 21: Đại học Tây Bắc Cụm thi số 22: Đại học Hùng Vương Cụm thi số 23: Đại học Sư phạm Hà Nội 2 Cụm thi số 24: Đại học Ngoại thương Cụm thi số 25: Đại học Kinh tế Quốc dân Cụm thi số 26: Đại học Giao thông vận tải Cụm thi số 27: Học viện Nông nghiệp Việt Nam Cụm thi số 28: Đại học Sư phạm kỹ thuật Hưng Yên Cụm thi số 29: Đại học Hải Phòng Cụm thi số 30: Đại học Thương mại Cụm thi số 31: Đại học Công nghiệp Hà Nội Cụm thi số 32: Đại học Y Dược Thái Bình Cụm thi số 33: Đại học Mỏ – Địa chất Cụm thi số 34: tĐại học Hồng Đức Cụm thi số 35: Đại học Vinh Cụm thi số 36: Đại học Sư phạm – Đại học Huế Cụm thi số 37: Đại học Khoa học – Đại học Huế Cụm thi số 38: Đại học Kinh tế – Đại học Huế Cụm thi số 39: Đại học Huế Cụm thi số 40: Đại học Đà Nẵng Cụm thi số 41: Đại học Bách khoa – Đại học Đà Nẵng Cụm thi số 42: Đại học Sư phạm – Đại học Đà Nẵng Cụm thi số 43: Đại học Quy Nhơn Cụm thi số 44: Đại học Xây dựng Miền Trung Cụm thi số 45: Đại học Nông Lâm Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 46: Đại học Ngoại ngữ – Đại học Đà Nẵng Cụm thi số 47: Đại học Tây Nguyên Cụm thi số 48: Đại học Tài chính Marketting Cụm thi số 49: Đại học Nha Trang Cụm thi số 50: Đại học Giao thông vận tải Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 51: Đại học Sư phạm Kĩ thuật Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 52: Đại học Đà Lạt Cụm thi số 53: Đại học Kinh tế Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 54: Đại học Kinh tế – Luật, Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 55: Đại học Công nghiệp Thực phẩm Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 56: Đại học Công nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 57: Đại học Sài Gòn Cụm thi số 58: Đại học Đồng Tháp Cụm thi số 59: Đại học An Giang Cụm thi số 60: Đại học Tôn Đức Thắng Cụm thi số 61: Đại học Tiền Giang Cụm thi số 62: Đại học Cần Thơ – Thành phố Cần Thơ Cụm thi số 63: Đại học Cần Thơ – Hậu Giang Cụm thi số 64: Đại học Luật Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 65: Đại học Sư phạm Kỹ thuật Vĩnh Long Cụm thi số 66: Đại học Trà Vinh Cụm thi số 67: Trường Đại học Ngân hàng Thành phố Hồ Chí Minh Cụm thi số 68: Đại học Cần Thơ – Bạc Liêu Cụm thi số 69: Đại học Kiên Giang Cụm thi số 70: Đại học Y Dược Cần Thơ Danh sách cụm thi tốt nghiệp công bố điểm thi THPT quốc gia 2016: 1. Cụm thi số 1: Sở Giáo dục và Đào tạo Hà Nội 2. Cụm thi số 2: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Hà Giang 3. Cụm thi số 3: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Cao Bằng 4. Cụm thi số 4: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Lai Châu 5. Cụm thi số 5: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Điện Biên 6. Cụm thi số 6: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Lào Cai 7. Cụm thi số 7: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Tuyên Quang 8. Cụm thi số 8: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Lạng Sơn 9. Cụm thi số 9: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Bắc Cạn 10. Cụm thi số 10: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Thái Nguyên 11. Cụm thi số 11: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Yên Bái 12. Cụm thi số 12: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sơn La 13. Cụm thi số 13: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Phú Thọ 14. Cụm thi số 14: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Vĩnh Phúc 15. Cụm thi số 15: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Quảng Ninh 16. Cụm thi số 16: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Bắc Giang 17. Cụm thi số 17: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Bắc Ninh 18. Cụm thi số 18: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Hải Dương 19. Cụm thi số 19: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Hưng Yên 20. Cụm thi số 20: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Hòa Bình 21. Cụm thi số 21: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Hà Nam 22. Cụm thi số 22: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Nam Định 23. Cụm thi số 23: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Thái Bình 24. Cụm thi số 24: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Ninh Bình 25. Cụm thi số 25: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Thanh Hóa 26. Cụm thi số 26: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Nghệ An 27. Cụm thi số 27: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Quảng Bình 28. Cụm thi số 28: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Quảng Trị 29. Cụm thi số 29: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Thừa thiên – Huế 30. Cụm thi số 30: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Quảng Nam 31. Cụm thi số 31: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Quảng Ngãi 32. Cụm thi số 32: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Bình Định 33. Cụm thi số 33: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Gia Lai 34. Cụm thi số 34: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Kon Tum 35. Cụm thi số 35: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Đắk Lắk 36. Cụm thi số 36: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Đắk Nông 37. Cụm thi số 37: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Khánh Hòa 38. Cụm thi số 38: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Ninh Thuận 39. Cụm thi số 39: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Lâm Đồng 40. Cụm thi số 40: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Đồng Nai 41. Cụm thi số 41: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Đồng Tháp 42. Cụm thi số 42: Sở Giáo dục và Đào tạo thành phố Cần Thơ 43. Cụm thi số 43: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Hậu Giang 44. Cụm thi số 44: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Bến Tre 45. Cụm thi số 45: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Vĩnh Long 46. Cụm thi số 46: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Trà Vinh 47. Cụm thi số 47: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Sóc Trăng 48. Cụm thi số 48: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Bạc Liêu 49. Cụm thi số 49: Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Kiên Giang 50. Cụm thi số 50: Cục Nhà trường, Bộ Quốc phòng 

Trong kỳ thi THPT quốc gia 2016, đã có khoảng 880.000 thí sinh đăng ký dự thi. Tỷ lệ sĩ tử đến làm bài thi là hơn 90%. Đặc biệt, số thí sinh dự thi chỉ để xét tốt nghiệp tăng mạnh so với năm ngoái. Đây được coi là một tín hiệu đáng mừng khi các em đã không còn coi đại học, cao đẳng là con đường duy nhất sau khi tốt nghiệp THPT. Đề thi năm nay được đánh giá là có tính phân loại cao, khó đạt điểm giỏi. Tuy nhiên các hội đồng đều nhận định là khó thì khó chung, do đó điểm chuẩn có thể giảm nếu phổ điểm trung bình giảm xuống.